¿Cuál es la alternativa al método findByIdAndUpdate si queremos actualizar un documento sin utilizar el operador $set?

Contacto._____('5a0e1991075e9407c4da8b0a', 
    { nombre: 'Nacho Iborra', edad: 40 } , { new: true })
.then(resultado => {
    console.log("Modificado contacto:", resultado);
}).catch (error => {
    console.log("ERROR:", error);
});